ارائه روشی برای تشخیص بیماری سرطان به کمک داده کاوی پروتئوم انسان
پایان نامه
- دانشگاه تربیت معلم - سبزوار - دانشکده فنی
- نویسنده محمد علی پور
- استاد راهنما جواد حدادنیا
- تعداد صفحات: ۱۵ صفحه ی اول
- سال انتشار 1388
چکیده
پروتئین به عنوان محصول اصلی ژن و عامل اصلی فعل و انفعالات سلول، می تواند کلید حل معمای سرطان باشد. از آنجا که شناخت پروتئینها، به منظور درک فرآیندهای متابولیکی جاری بدن لازم بوده و بسیاری از بیماری ها خود را در سطح پروتئینی نشان میدهد، و با توجه به اینکه مطالعه ژنوم به تنهایی برای درک عملکرد پروتئین ها کافی نیست، تحقیقات پروتئومیکس طی یک دهه گذشته، به طور چشمگیری مورد توجه واقع شده است. یکی از زمینه های کاربردی پروتئومیکس، تمایز پروتئین ها در نمونه های سالم و بیمار است. یکی از روشهای متداول برای شناسایی پروتئین های موجود در یک ترکیب طیف نگاری جرمی پروتئین است. در روش طیف نگاری جرمی فراوانی نسبی پروتئین های موجود در یک ترکیب بر حسب نرخ جرم به بار این پروتئین ها رسم میشود. طیف جرمی نمونه خون افراد، حداقل 15000 نقطه داده فراهم میکند که پردازش آن را دشوار و چالش برانگیز می سازد. در این رساله 4 روش جدید برای آنالیز طیف جرمی و طبقه بندی سرطان و یک روش جدید برای بصری سازی اطلاعات طیف جرمی پروتئومیک ارائه شده است. روش اول یک چهارچوب bpso/svm برای شناسایی نشانگرهای زیستی سرطان است که در پایگاه دادگان سرطان تخمدان، منجر به انتخاب 3 ویژگی و طبقه بندی 100% گردید. این نتیجه بهترین نتیجه موجود (از نظر کاهش ویژگیها و دقت) در مقایسه با روش های پیشین است. استفاده از bpso/svm برای انتخاب ویژگی برای اولین بار در این رساله مطرح و تشریح شده است. سه روش دیگر مبتنی بر نحوه جدید نمایش اطلاعات طیف جرمی، ارائه شده اند. روش بصری سازی جدید، طیف جرمی را بصورت یک تصویر شدت نمایش میدهد. دو مورد از روشهای مبتنی بر این نوع نمایش، از آنالیز الگوی پروتئومیک بجای بررسی نشانگرها استفاده میکنند. در نخستین روش از روشهای سه گانه مذکور، طبقه بندی کننده فاصله با مرجع تصویر میانگین کلاس ها استفاده شد و نرخ طبقه بندی متوسط 96.50% را به همراه داشت. در روش بعدی، همانند سیستم های سنتی شناسایی الگو، از تبدیل موجک گسسته و نیز تبدیل کسینوسی گسسته برای استخراج ویژگی از تصاویر طیف جرمی بهره گرفتیم. که دقت شناسایی متوسط در مورد اول 99.64% و در مورد دوم 98.94% بدست آمد. سومین روش مبتنی بر تصویر طیف جرمی، از یک الگوریتم جدید شناسایی قله برای استخراج نشانگرهای زیستی و طبقه بندی کننده svm، برای ارزیای عملکرد سیستم سود می برد. این روش منجر به کاهش ویژگیهای طیفی جرمی به 340 و نرخ شناسایی 100% گردید.
منابع مشابه
ارائه روشی نوین برای تشخیص نفوذ در سیستم های پایگاه داده ای به کمک مفاهیم داده کاوی
امنیت کامپیوترها و شبکه ها یک مسئله حیاتی در دنیای امروزی ما می باشد. یک روش برای حفاظت اطلاعات ذخیره شده در سیستم های پایگاه داده ای استفاده از سیستم تشخیص نفوذ می باشد. اخیراً محققان روی تکنیک های داده کاوی ای کار می کنند که تراکنش های بدخواه در سیستم های پایگاه داده ای را کشف می کنند. روش آن ها روی استنتاج وابستگی های داده بین اجزاء داده در پایگاه داده متمرکز است، اما الگوریتم هایی که این روش...
15 صفحه اولتشخیص ناباروری به کمک تکنیک های داده کاوی
زمینه و هدف: با توجه به جمع آوری حجم بالای داده ها در مراکز درمانی و استفاده مناسب از آنها جهت کشف و تشخیص بیماری، نیاز به علم و ابزاری که روی این داده ها تحلیل انجام دهد، لازم و ضروری است. در این مطالعه تشخیص ناباروری به کمک تکنیک های داده کاوی مورد بررسی قرار گرفت. روش بررسی: در این مطالعه اطلاعات از میان پرونده های مراجعه کنندگان مرکز درمان ناباروری جهاد دانشگاهی قم استخراج و 700 نمونه از می...
متن کاملپیش بینی عود مجدد سرطان پستان به کمک سه تکنیک داده کاوی
مقدمه: تعداد و اندازه پایگاه داده های پزشکی به سرعت در حال افزایش است و مدل های توسعه یافته تکنیک داده کاوی می توانند برای پزشکان جهت کمک در تصمیم گیری موثر و کاربردی باشند. هدف اصلی از این مقاله، گزارش یک پروژه تحقیقاتی به منظور مقایسه الگوریتم های مختلف داده کاوی از طریق مقایسه حساسیت، ویژگی و دقت بین آنها، جهت انتخاب دقیق ترین مدل برای پیش بینی عود مجدد سرطان پستان در زنان مبتلا بوده است. د...
متن کاملارائه روشی جدید به منظور تشخیص نفوذ به شبکه با داده کاوی
امروزه با گسترش روزافزون شبکه های کامپیوتری، امنیت شبکه از اولویت زیادی برخوردار می-شود. سیستم های تشخیص نفوذ، سخت افزار و یا نرم افزاری است که کار نظارت بر شبکه کامپیوتری را در مورد فعالیت های مخرب و یا نقض سیاستهای مدیریتی و امنیتی انجام می دهد و گزارش های حاصل را به بخش مدیریت شبکه ارائه میدهد. رویکردهای تشخیص نفوذ به دو دسته کلی تشخیص موارد سوءاستفاده و تشخیص موارد غیر متعارف تقسیم می شوند....
15 صفحه اولکاربرد داده کاوی در بیماران مبتلا به بیماری آسم
Background and Aim: Data mining is a very important branch in deeper understanding of medical data, which attempts to solve problems in the diagnosis and treatment of diseases. One of the most important data mining applications is to examine the existing data patterns. The present study aims to examine the existing data patterns of patients with asthma. Materials and Methods: This study wa...
متن کاملمنابع من
با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید
ذخیره در منابع من قبلا به منابع من ذحیره شده{@ msg_add @}
نوع سند: پایان نامه
دانشگاه تربیت معلم - سبزوار - دانشکده فنی
کلمات کلیدی
میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com
copyright © 2015-2023